1559–1564
Academia din Geneva și moartea lui Calvin
În 1559, Academia s-a deschis la Geneva sub conducerea lui Theodor Beza, viitorul succesor al lui Calvin. Aceasta a atras studenți din toată Europa, care au dus calvinismul înapoi în țările lor de origine. În același an a apărut ediția latină finală a „Învățăturii religiei creștine”, urmată de ediția franceză finală în 1560.
Calvin a murit la 27 mai 1564. Guillaume Farel a fost ultimul care l-a vizitat. Până la acea dată, biserica reformată devenise un organism la fel de instituționalizat ca Biserica Catolică. Avea comunități în Țările de Jos, Scoția, Ungaria, Franța și în alte părți.